La EMMA surge de un proceso de reflexión sobre la función que cumple el Plan de Medio Ambiente de Andalucía (PMA). En este proceso de reflexión se identifica la necesidad de ajustar los objetivos y contenidos del PMA a la función que ha estado cumpliendo en la práctica.
El Plan de Medio Ambiente se ha formulado en tres ocasiones desde 1997. En este año se aprobó el primero de estos documentos (PMA 1997-2002), al que sucedieron dos más (PMA 2004-2010 y PMA 2012- 2017). En el contexto del primer Plan era necesaria la figura de un plan abarcador que integrara en un instrumento de planificación un conjunto de iniciativas que entonces estaban dispersas.